1896年英属加拿大传教士劳海德在"卫辉府"(今河南省新乡市所辖的卫辉市)开办了基督教"博济医院"(后易名为"惠民医院")。"博济医院"在行医的同时也开办有短期各科医士培训教育。1922年,加拿大传教士吉内特·维特立夫又在此兴办了四年制惠民医院护士学校,致力于培养现代医学护理人才。
1949年6月随着解放战争的推进,成立于1947年的冀鲁豫行署卫生学校携哈利生医院从山东章丘迁至卫辉,哈利生医院与原惠民医院合并组建了平原省省立医院。
1950年1月,平原省教育厅、卫生厅决定在卫生学校的基础上成立平原省医科学校, 平原省医院为医科学校附属医院,首任校长是时任平原省卫生局局长的李奕,同年5月学校招收第一批学生。这就是新乡医学院的前身。
此后,学校几经变迁,经历华北第二医士学校、汲县医士学校、汲县卫生学校、新乡专区医学院、汲县医学专科学校、豫北医学专科学校等发展阶段。
1982年经国务院批准学校升格为本科,定名新乡医学院,同时在新乡市建设新校区。
1991年学校实现了办学主体由卫辉向新乡的搬迁。
1996年通过原国家教委组织的本科教学工作合格评价。
1998年学校获硕士学位授予权。
2006年接受教育部本科教学工作水平评估，评估结论为优秀。
(注：文中所引用数字系 2006年10月统计数据)