个人简介
徐永涛，中共党员，博士研究生，教授，硕士研究生导师，河南省高校科技创新人才，新乡医学院“太行青年学者”，“青年教学标兵”，新乡医学院医学工程学院医学装备成果转化办公室主任，河南省神经信息分析与药物智能设计国际联合实验室常务副主任，新乡市生物医学信息研究重点实验室主任，中国医药教育协会智能医学专业委员会常务委员。2013年12月获得英国女王大学计算生物学与计算化学博士学位。主要从事医学信息研究方面的教学科研工作，研究方向为智能药物设计。近年来个人共发表论文38篇（中科院分区1区5篇，2区8篇），参与学术著作3部。主持或参与国家自然科学基金项目4项，主持国家留学基金委项目1项、省级科研项目5项、指导省大创项目2项，获国家发明专利2项（美国发明专利1项），主持获得中国医药教育协会科技创新奖二等奖（省部级）。
联系方式：
新乡医学院北校区科技楼七楼733室
电话：0373-3831393
mail: yxu@xxmu.edu.cn;
研究方向：
智能药物设计：抗病毒或抗癌小分子创新药物研发
智能医学：人工智能在医学上的应用
招生方向：
学术学位硕士（学硕）：生物医学工程
专业学位硕士（专硕）：电子信息
教育经历：
2010/09-2013/12，英国女王大学，计算生物学与计算化学，博士
2009/09-2010/08，浙江大学，软件工程，硕士
2001/09-2006/07，北京科技大学，信息管理与信息系统，学士
承担项目：
(1)河南省科技厅，河南省自然科学基金面上项目，252300421457，2025-01至2026-12，10万元，在研，主持
(2)河南省人力资源和社会保障厅，2023年度留学人员科研择优资助，2023-01至2024-12，5万元，在研，主持
(3)河南省教育厅，河南省高校科技创新人才，22HASTIT050，计算设计精准靶向主蛋白酶的抗新冠病毒小分子抑制剂及实验验证，2022-01至2024-12，30万元，在研，主持
(4)国家自然科学基金委员会，青年项目，21603180，计算设计以信封蛋白为靶点的抗登革热病毒肽抑制剂与初步实验验证，2017-01至2019-12，20万元，结项，主持
(5)国家自然科学基金委员会, 联合项目, U1704184，特异性靶向LSD1小分子降解剂的设计、合成及抗肿瘤活性研究，2018-01至2020-12，51万元，结项，参与
(6)国家自然科学基金委员会，青年项目，21803049，黄酮醇-金纳米抗氧化剂生物界面性质和生物相容性的研究，2019-01至2021-12，26万元，结项，参与
(7)国家留学基金委员会，地方合作项目，201708410492，计算设计螺旋蛋白为靶点的抗癌抑制剂研究，2018-09至2019-09，15万元，结项，主持
(8)河南省教育厅，河南省科技攻关项目，202102310875, 计算设计抗新冠病毒小分子药物及实验验证，2021-01至2022-12，5万元，在研，主持
(9)河南省教育厅，202110472028，计算设计精准靶向NS5B聚合酶的新型抗丙型肝炎病毒小分子抑制剂，2022-01至2022-12，2万元，指导教师
(10)河南省财政厅，河南省外专局项目，2014【131】，统计势能在评价蛋白稳定性的应用，2014-10至2015-01，5万元，结项，主持
近五年代表性论文
(1) Han, D., Yang, H., Gao, Y., Xue, Y., Liu, F., Wang, M., Xu, Y*. (2025). Virtual Screening and Molecular Simulation Uncover Potent Traditional Chinese Medicine Small Molecules Against SARS‐CoV‐2 Mpro. ChemistrySelect, 10(12), e202405037.SCI/四区/1.9
(2) Zhao, Z., Ran, X., Niu, Y., Qiu, M., Lv, S., Zhu, M., Xu, Y.,Yu, Y. Predicting Treatment Response of Repetitive Transcranial Magnetic Stimulation in Major Depressive Disorder Using an Explainable Machine Learning Model Based on Electroencephalography and Clinical Features. Biological Psychiatry: Cognitive Neuroscience and Neuroimaging.SCI/二区/5.7
(3) Zhu, H. J., Zhou, H. M., Zhou, X. X., Li, S. J., Zheng, M. J., Xu, Z., Xu,Y., Duan, Y. C. (2024). Discovery of Novel 5-Cyano-3-phenylindole-Based LSD1/HDAC Dual Inhibitors for Colorectal Cancer Treatment. Journal of Medicinal Chemistry, 67(22), 20172-20202.SCI/一区/6.5
(4) Han, D., Zhao, F., Chen, Y., Xue, Y., Bao, K., Chang, Y., Xu, Y*. (2024). Distinct Characteristic Binding Modes of Benzofuran Core Inhibitors to Diverse Genotypes of Hepatitis C Virus NS5B Polymerase: A Molecular Simulation Study. International journal of molecular sciences, 25(15), 8028. SCI/二区/4.9
(5) Wang, M., Fan, B., Lu, W., Ryde, U., Chang, Y., Han, D., Xu, Y*. (2024). Unraveling the Binding Mode of Cyclic Adenosine–Inosine Monophosphate (cAIMP) to STING through Molecular Dynamics Simulations. Molecules, 29(11), 2650.SCI/二区/4.9
(6) 鲁文凤,路嘉瑞,韩迪,高云龙，徐永涛*.白藜芦醇衍生物作为新型LSD1/HDAC双靶点抑制剂的计算模拟研究[J].化学研究与应用, 2024(003):036.中文核心期刊
(7) Han, D., Lu, J., Fan, B., Lu, W., Xue, Y., Wang, M., Xu, Y*. (2024). Lysine-Specific Demethylase 1 Inhibitors: A Comprehensive Review Utilizing Computer-Aided Drug Design Technologies. Molecules, 29(2), 550.SCI/二区/4.9
(8) Gao, Q., Guo, Y., Cao, P., Fan, G., Xu, Y*. (2023). Regioselective synthesis of indazolo [2, 3-a] quinazolines enabled by I 2/S-facilitated annulation relay dehydrogenative aromatization of cyclohexanones. Chemical Communications, 59(93), 13835-13838.SCI/二区top/6.1
(9) 贾梦珠,韩迪,路嘉瑞,高云龙,徐永涛*.基于丁酸钠的新型HDAC4抑制剂的设计与模拟[J].化学研究与应用,2023,35(07):1556-1564.中文核心期刊
(10) 畅豫霄,董亚东,徐永涛*.基于图卷积神经网络和拓扑特征的微核糖核酸-疾病关联预测模型[J].生物医学工程研究,2023,42(02):122-130.中文核心期刊
(11) Duan, Y., Yu, T., Jin, L., Zhang, S., Shi, X., Zhang, Y.,Xu, Y* .,Guan, Y. (2023). Discovery of novel, potent, and orally bioavailable HDACs inhibitors with LSD1 inhibitory activity for the treatment of solid tumors. European Journal of Medicinal Chemistry, 254, 115367.SCI/一区/5.6
(12) Li, T., Cui, N., Fan, J., Liu, X., Guan, J., Zhang, W., Xu, Y., Wang, Y. (2022). Engineering β-agarase Aga0917 from Pseudoalteromonas fuliginea YTW1-15-1 to Improve the Thermostability and Enzyme Activity. ACS Sustainable Chemistry & Engineering, 10(47), 15437-15449.SCI/一区/8.1
(13) Xu, Y., Fan, B., Gao, Y., Chen, Y., Han, D., Lu, J., Wang, M. (2022). Design two novel tetrahydroquinoline derivatives against anticancer target LSD1 with 3D-QSAR model and molecular simulation. Molecules, 27(23), 8358.SCI/二区/4.9
(14) Zhou, X. L., Zhao, F., Xu, Y., Guan, Y. Y., Yu, T., Zhang, Y. Z., Zhao, Y. (2022). A comprehensive review of BET-targeting PROTACs for cancer therapy. Bioorganic & Medicinal Chemistry, 73, 117033.SCI/三区/3.6
(15) Gao, Q., Sun, Z., Wu, M., Guo, Y., Han, X., Yan, J., Xu, Y∗. (2022). Di-tert-butyl peroxide as an effective two-carbon unit in oxidative radical cyclization toward 7-methylazolo [1, 5-a] pyrimidines. Organic Chemistry Frontiers, 9(11), 3050-3056.SCI/一区/5.3
(16) Xu, Y., Gao, Y., Yang, M., Wang, M., Lu, J., Wu, Z., Han, D. (2021). Design and identification of two novel resveratrol derivatives as potential LSD1 inhibitors. Future Medicinal Chemistry, 13(17), 1415-1433.SCI/二区/3.8
(17) 陈依帆,赵俊强,杨敏,贺子豪,高云龙,刘鸿仪,徐永涛*.二苯乙烯类LSD1抑制剂的分子对接及分子动力学模拟研究[J].分子科学学报,2021,37(03):206-213.中文核心/中国科技核心期刊
(18) Zhao, Z., Li, J., Niu, Y., Wang, C., Zhao, J., Yuan, Q., Xu, Y., Yu, Y. (2021). Classification of schizophrenia by combination of brain effective and functional connectivity. Frontiers in Neuroscience, 15, 651439. SCI/二区/3.7
(19) Duan, Y. C., Jin, L. F., Ren, H. M., Zhang, S. J., Liu, Y. J., Xu, Y., Guan, Y. Y. (2021). Design, synthesis, and biological evaluation of novel dual inhibitors targeting lysine specific demethylase 1 (LSD1) and histone deacetylases (HDAC) for treatment of gastric cancer. European journal of medicinal chemistry, 220, 113453. SCI/一区/6.5
(20) Li, X., Liu, H., Wu, X., Xu, R., Ma, X., Zhang, C., Xu, Y∗. (2021). Exploring the interactions of naringenin and naringin with trypsin and pepsin: experimental and computational modeling approaches. Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy, 258, 119859.SCI/二区/4.1
(21) Yu, J., Li, X., Liu, H., Peng, Y., Wang, X., Xu, Y∗. (2021). Interaction behavior between five flavonoids and pepsin: Spectroscopic analysis and molecular docking. Journal of Molecular Structure, 1223, 128978.SCI/三区/3.1
(22) 刘鸿仪,杨敏,陈依帆,贺子豪，张松杰，徐永涛*.Mtb_G5K同源建模及其与[3, 2-c]喹啉对接研究.化学研究与应用,2020, 32(7):1200-1206.中文核心/CA收录
(23) Gao, Q., Wu, M., Zhang, K., Yang, N., Liu, M., Li, J., Xu, Y∗. (2020). I2-catalyzed aerobic α, β-dehydrogenation and deamination of tertiary alkylamines: Highly selective synthesis of polysubstituted pyrimidines via hidden acyclic enamines. Organic Letters, 22(14), 5645-5649.SCI/一区/6.5
(24) Zhao, Z., Wang, C., Yuan, Q., Zhao, J., Ren, Q.,Xu, Y.,Yu, Y. (2020). Dynamic changes of brain networks during feedback-related processing of reinforcement learning in schizophrenia. Brain Research, 1746, 146979.SCI/三区/3.2
(25) Wang, C., Zhao, Z., Ren, Q., Xu, Y., Yu, Y. (2020). A novel multi-focus image fusion by combining simplified very deep convolutional networks and patch-based sequential reconstruction strategy. Applied Soft Computing, 91, 106253.SCI/二区/6.7
(26) Li, X., Peng, Y., Liu, H., Xu, Y., Wang, X., Zhang, C.,Ma, X. (2020). Comparative studies on the interaction of nine flavonoids with trypsin. Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy, 238, 118440.SCI/二区/4.1
(27) Xu, Y., He, Z., Liu, H., Chen, Y., Gao, Y., Zhang, S., Yang, M. (2020). 3D-QSAR, molecular docking, and molecular dynamics simulation study of thieno[3,2-B] pyrrole-5-carboxamide derivatives as LSD1 inhibitors. RSC Adv 10: 6927–6943.SCI/三区/3.3
(28) Xu, Y., He, Z., Yang, M., Gao, Y., Jin, L., Wang, M., Duan, Y. (2019). Investigating the binding mode of reversible LSD1 inhibitors derived from stilbene derivatives by 3D-QSAR, molecular docking, and molecular dynamics simulation. Molecules, 24(24), 4479.SCI/三区/4.4
(29) 贺子豪,赵俊强,杨敏,张松杰,徐永涛*.使用遗传算法优化登革热病毒信封蛋白的肽抑制剂. 河南师范大学学报(自然科学版), 2019, 47(06):38-44. 中文核心
(30) Wang, C., Zhao, Z., Ren, Q., Xu, Y., Yu, Y. (2019). Dense U-net based on patch-based learning for retinal vessel segmentation. Entropy, 21(2), 168.SCI/三区/2.5
(31) Lu, X., Zhang, T., Wan, R., Xu, Y., Zhao, C.,Guo, S. (2018). Numerical investigation of narrowband infrared absorber and sensor based on dielectric-metal metasurface. Optics express, 26(8), 10179-10187.SCI/二区/3.9
(32) 赵俊强*，徐永涛，陈继超. 基于 Shearlet 变换结合动态融合的遥感图像融合算法.电子测量与仪器学报. 2018,32(11):35-42. CSCD
(33) Amir-Hassan, A., Lee, V. S., Baharuddin, A., Othman, S., Xu, Y., Huang, M., Othman, R. (2017). Conformational and energy evaluations of novel peptides binding to dengue virus envelope protein. Journal of Molecular Graphics and Modelling, 74, 273-287.SCI/四区/2.5
(34) Yu, L.,Xu, Y∗., Wang, F., Yang, C., Liu, G., Song, X. (2016). Functional Roles of Pattern Recognition Receptors That Recognize Virus Nucleic Acids in Human Adipose‐Derived Mesenchymal Stem Cells. BioMed research international, 2016(1), 9872138.SCI/三区/3.4
(35) Mooney, M. C., Xu, Y., McClory, J.,Huang, M. (2016). A disappearing act performed by magnesium: the nucleotide exchange mechanism of Ran GTPase by quantum mechanics/molecular mechanics studies. Theoretical Chemistry Accounts, 135, 1-13. SCI/三区/1.8
(36) Xu, Y., Yu, S., Zou, J. W., Hu, G., Rahman, N. A., Othman, R. B., ... & Huang, M. (2015). Identification of peptide inhibitors of enveloped viruses using support vector machine. PLoS One, 10(11), e0144171.SCI/三区/3.2
(37) Xu, Y., Zhou, X.,Huang, M. (2015). StaRProtein, A Web Server for Prediction of the Stability of Repeat Proteins. Plos one, 10(3), e0119417.SCI/三区/3.2
(38) Baharuddin, A., Hassan, A. A., Othman, R., Xu, Y., Huang, M., Tejo, B. A., ... & Othman, S. (2014). Dengue envelope domain III-peptide binding analysis via tryptophan fluorescence quenching assay. Chemical and Pharmaceutical Bulletin, 62(10), 947-955.SCI/四区/1.4
(39) Xu, Y., Rahman, N. A., Othman, R., Hu, P.,Huang, M. (2012). Computational identification of self‐inhibitory peptides from envelope proteins. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, 80(9), 2154-2168.SCI/三区/3.7
获奖情况：
(1) 2022年高等教育（本科）国家级教学成果奖：医科虚拟仿真教学资源共建共享模式创新与实践（第三），二等奖，教育部，2023
(2) 国家级一流本科课程认定：植入式心脏起搏器构造及工作原理虚拟仿真实验（第二），教育部，2022
(3) 河南省高等教育教学成果特等奖：“新医科”建设背景下虚拟仿真“金课”资源共建共享模式研究（第四），河南省教育厅，2022
(4) 河南省研究生高等教育教学成果二等奖：“新医科”+“新工科”背景下医工交叉融合专业型研究生培养模式构建研究，河南省教育厅，2024
(5) 第三届全国智能技术大赛二等奖， 基于中药大数据的抗新冠肺炎智能靶向药物设计（指导教师），中国医药教育协会，2022
(6) 第三届全国智能技术大赛三等奖， 基于深度图像卷积神经网络的疾病相关miRNA预测（指导教师），中国医药教育协会，2022
(7) 教育信息化理论研究与创新应用，互联网+教育新生态下的医学计算机基础一流课程建设，一等奖，河南省教育厅，第二，2021
(8) 教育部产学合作协同育人项目：脑解剖与神经电信号传导MR/AR 虚拟仿真教学资源库建设（第三），已结项，2021
(9) 河南省教育厅科技成果一等奖，基于VR技术的膝关节解剖教学与临床手术实训系统研发与应用（第六），2021
(10) 第三届全国智能技术大赛三等奖， 智能虚拟筛选精准靶向NS5B抗丙肝病毒小分子药物模型（指导教师），2021
(11) 第三届全国智能技术大赛三等奖， 高通量智能设计精准靶向HDAC抗癌小分子药物模型（指导教师），2021
(12) 中国医药教育协会科技创新奖二等奖， 计算设计抗新冠病毒小分子药物及实验验证，主持，2020
(13) 第二届全国智能技术大赛一等奖， 抗新冠肺炎靶向药物的药效团模型设计（指导教师），2020
(14) 河南省本科教育线上教学优秀课程二等奖，计算机基础（第六），2020
(15) 河南省一流本科课程，计算基础（第三），2020
(16) 河南省社科联、河南省经团联调研课题，教育信息化背景下“个性化”教学模式研究，一等奖，河南省社科联，第三，2019
(17) 河南省第三届信息技术与课程融合优质课大赛，计算机与医学，一等奖，河南省教育厅，第一，2017
(18) 河南省社科联、河南省经团联调研课题，互联网+时代医学院校计算机基础教学改革有效性研究，一等
