期刊社成立于1999年，现设有期刊社办公室、《新乡医学院学报》编辑部、《眼科新进展》编辑部、《中华实用儿科临床杂志》编辑部、网络与数字出版部、市场推广部。社长1人，副社长2人。现有正式在编职工18人，其中高级职称9人，中级职称6人，初级职称3人。现有正式党员14人。所属3份杂志(《新乡医学院学报》、《眼科新进展》、《中华实用儿科临床杂志》)均为“中国科技论文统计源期刊”(中国科技核心期刊)，其中《眼科新进展》和《中华实用儿科临床杂志》为全国中文核心期刊。

《新乡医学院学报》创刊于1984年，现为月刊，是新乡医学院主管、主办的国内外公开发行的综合性医学学术期刊，国际标准连续出版物号：ISSN 1004-7239，国内统一刊号：CN 41-1186/R。《新乡医学院学报》设有“专家论坛、专题报告、国家自然科学基金专题述评、基础研究、临床研究、综述”等栏目。《新乡医学院学报》为中国科技论文统计源期刊(中国科技核心期刊)、中国精品科技期刊、中国高校优秀科技期刊、中国科技论文在线优秀期刊、河南省一级期刊、RCCSE(中国科学评价研究中心)中国核心学术期刊A，并被波兰《哥白尼索引》、英国《公共卫生数据库》、英国国际农业与生物科学研究中心数据库、美国《剑桥科学文摘(自然科学)》、《化学文摘》和《乌利希期刊指南》、WHO西太平洋地区医学索引(WPRIM)、中国期刊网、《中国学术期刊(光盘版)全文检索数据库》、《万方数据-数字化期刊群》、《中国核心期刊(遴选)数据库》、《中国生物医学文献光盘数据库》、《中文生物医学期刊文献数据库》、《中文科技期刊数据库》、《中国期刊全文数据库》和《中文电子期刊服务资料库》等重要文摘、数据库收录。

《眼科新进展》创刊于1980年9月，现为月刊，是新乡医学院主管、主办的国内外公开发行的眼科学专业学术期刊，国际标准连续出版物号：ISSN 1003-5141，国内统一刊号：CN41-1105/R。《眼科新进展》主要栏目包括“述评、实验研究、应用研究、文献综述”。现为全国中文核心期刊、中国科技论文统计源期刊(中国科技核心期刊)、河南省二十佳期刊、河南省一级期刊、RCCSE(中国科学评价研究中心)中国核心学术期刊，被美国《化学文摘》、俄罗斯《文摘杂志》、WHO西太平洋地区医学索引(WPRIM)、《中国学术期刊文摘》、《中国学术期刊(光盘版)全文检索数据库》、《万方数据-数字化期刊群》等国内外重要数据库和权威性文摘杂志收录。

《中华实用儿科临床杂志》创刊于1986年1月，现为半月刊，是中国科学技术协会主管、中华医学会主办、新乡医学院承办的中华医学会系列杂志，是以儿科临床与基础研究为主要报道内容的儿科学类核心期刊。CN 10-1070/R，ISSN 2095-428X，CODEN SELZBJ。国内外公开发行，国内邮发代号：36-102，国外邮发代号：SM 1763。辟有述评、专家论坛、学术争鸣、热点、论著、小儿神经基础与临床、中西医结合、实验研究、儿童保健、误诊分析、药物与临床、综述、小儿外科、病例报告、临床应用研究、儿科查房、标准·方案·指南、指南解读、国际期刊快通道、医学人文等栏目。中国科学引文数据库(CSCD)来源期刊、全国中文核心期刊、中国科技论文统计源期刊(中国科技核心期刊)、RCCSE中国核心学术期刊、中国科学技术协会精品科技期刊，先后入选中国生物医学文献数据库(CBMdisc)、Quick全文资料管理系统(FTME)、中文科技期刊数据库、万方数据、《中国学术期刊文摘》、美国《化学文摘》、俄罗斯《文摘杂志》、波兰《哥白尼文摘》、WHO西太平洋地区医学索引(WPRIM)、美国《乌利希斯期刊指南》等国内外数十家权威数据库。