共青团新乡医学院委员会是学校党委和上级团组织领导下的先进青年的群众组织，是党的助手和后备军，是学校思想政治教育的主要阵地和重要力量，是党联系青年学生的桥梁和纽带；是学校培养“四有”新人的助手，是励练人才的熔炉。
新乡医学院团委的根本任务是紧紧围绕学校党政中心工作，主动适应学校改革发展的实际和青年学生的新变化、新需求，努力提升青年学生综合素质，服务青年学生成长成才，服务青年学生就业创业，引导青年学生从我做起，从现在做起，从小事做起，为中华民族的伟大复兴建功立业，贡献青春，在实践中锻炼成为社会主义事业的合格建设者和接班人。
新乡医学院团委下设综合办公室、社团实践部、组织宣传部、大学生科技创新与校园文化部四个科级单位，校团委有专职团干7名。下设基层团委共有19个。